1985 yılında Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi’nden mezun olan Çetinsaya, doktorasını 1994 yılında Manchester Üniversitesi Orta Doğu Çalışmaları Bölümü’nde tamamladı. 1994-2001 yılları arasında Hacettepe Üniversitesi Kamu Yönetimi Bölümü’nde, 2002-2008 yılları arasında İstanbul Teknik Üniversitesi İnsan ve Toplum Bilimleri Bölümü’nde bulunan Çetinsaya, 1999’da Doçentlik, 2005’de ise Profesörlük unvanlarını almıştır. Eylül 2007-Haziran 2008 arasında Woodrow Wilson International Center for Scholars’da (Washington DC) misafir araştırmacı olarak bulunan Çetinsaya, Amerika Ortadoğu Çalışmaları Cemiyeti (MESA), 1994 Malcom H. Kerr Sosyal Bilimler Doktora Tez Ödülü Birinciliği ve İngiltere Orta Doğu Çalışmaları Cemiyeti (BRISMES), 1995 Leigh Douglas En İyi Doktora Tezi Ödülü’nün de sahibidir. Osmanlı tarihi, Türk siyasi tarihi, Türk dış politikası ve Ortadoğu konularında çalışmalar yapmakta olan Çetinsaya’nın ulusal ve uluslararası birçok makale ve tebliğinin yanı sıra Ottoman Administration of Iraq, 1890-1908 (London: Routledge, 2006) adlı bir kitabı yayımlanmıştır. Şu anda İstanbul Şehir Üniversitesi Rektörü olarak görev yapmaktadır.